作者:庄有猫
新毒株(或者叫新变种,new variant)被命名为VUI-202012/01,是今年9月份在英格兰东南部的伦敦或者肯特郡出现的。

根据外汇110英国科研人员的分析,伦敦目前有超过60%的新发新冠病例与新毒株有关,它占东部病例的59%,东南部病例的48%。截至12月13日,在英国已有近60个不同地区发现了1108例新毒株导致的病例。

VUI-202012/01出现了17个位点的突变,其中最重要的一个突变是刺突蛋白(Spike Protein)中的N501Y突变。刺突蛋白是新冠病毒表面与人体细胞表面ACE2受体结合的部位,而N501Y突变位于刺突蛋白的RBD区域。

新冠病毒是一种RNA病毒,RNA病毒出现突变是一件很正常的事情。刺突蛋白目前已出现了4000种突变,其中绝大多数突变对病毒没有影响,但这些突变可以用于病毒的溯源,只有少部分一些突变(比如之前的D614G和现在的N501Y)会影响到病毒的传染力。

从理论上讲,N501Y突变可能导致病毒更具感染力,使得新毒株更容易人传人。另外,N501Y突变同时也出现在南非新出现的毒株上(南非毒株和英格兰毒株无关,只是正好两者都有该突变)。

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PS1:顺便说一下「传播力提高70%」是怎么来的,这个知识点其实对于普通人来说完全不需要了解,可以直接跳过。但是既然评论区有朋友提出来了,我就简单解释一下。

今年9月份发表在Cell上的一篇论文(见下)研究了新冠病毒突变与ACE2结合力的关系,其中就提到一点,新冠病毒刺突蛋白RBD位点的Q493、Q498和N501突变会提高病毒与人体细胞表面ACE2受体的亲和力(affinity),因为这些突变可以降低RBD关键残基的极性。关于N501Y突变的亲和力变化,请看我箭头指出来的地方。

Starr, T. N. , Greaney, A. J. , Hilton, S. K. , Ellis, D. , & Bloom, J. D. . (2020). Deep mutational scanning of sars-cov-2 receptor binding domain reveals constraints on folding and ace2 binding. Cell, 182(5).

而亲和力提高,通常意味着只需要更少量的病毒就可以实现同样程度的感染。

不知道大家还记不记得今年2月份的时候,有一个新闻说「美国研究显示「新冠病毒传染性是 SARS 的 20 倍」」,当时我写了个辟谣文章,和这个是同一个道理,感兴趣的朋友可以看一下。美国研究显示「新冠病毒传染性是 SARS 的 20 倍」,这个结论科学吗?

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还有一点,新闻中提到的「传播力高出70%」是相对而言的概念,对普通人而言更重要的指标是R0。

R0是基本传染数(Basic Reproductive Number)的意思,简单理解就是在没有外力介入的情况下、大家都没有免疫力的情况下,一个感染者平均可以传染给几个人。

所以R0越高,说明这个病原体传染性越强。(顺便说一个可以装逼但实际上没什么鸟用的知识点,R0标准读法是R naught,虽然大多数人都读做R零。)

根据测算,新毒株会将目前英国新冠疫情的R0提高0.4,也就是一个感染者较之前会多传染给0.4个人。对于即将迎来圣诞节的英国,这0.4会让英国的医疗系统承受更大的压力。

(经知友提出,增加0.4的应该是有效传染数Rt,英国Rt本来低于1了。)

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PS2:

20201221更新:我找到英国NERVTAG(New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group)的会议报告了,说重点(以下用新毒株代替VUI-202012/01)。

-传染力:根据基因组数据分析,新毒株的传染力提高71%(95%置信区间67%~75%)。

-R值与变异的相关性:新毒株导致R值绝对增长0.39~0.93。

-病毒核酸浓度:新毒株在PCR检测中的CT值(到达预先设定阈值的循环数)降低了2次,证明新毒株样本中核酸浓度更高。

-病死率:1000位新毒株感染的患者中出现4例死亡,与其他毒株基本持平,但还需进一步调查。

-增长速度:新毒株病例在封城期间出现指数性增长。

-病例输出:其他国家很少有新毒株,但是澳大利亚已经发现一例英国输出的新毒株。

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目前最重要的信息是,没有证据表明新毒株更致命或者会引起更严重的疾病,也没有证据表明疫苗对新毒株的效力会降低。

对于中国人而言,国外越来越多的新冠病例、高传染性新毒株的出现,加之冬春季本身就是呼吸道传染病高发,国内防疫难度会逐渐增大。对于每个个体而言,请继续做好个人防控——勤洗手、戴口罩和保持社交距离。